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Ingenuity iReport智能数据分析
Ingenuity iReport智能数据分析
英文名称:Ingenuity iReport总访问:2313
国产/进口:国产半年访问:306
产地/品牌:QIAGEN产品类别:生物信息软件
型       号:Ingenuity iReport 最后更新:2019-6-22
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销售商: 凯杰企业管理(上海)有限公司 查看该公司所有产品 >>
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  • 公司简介

 适用于快速理解表达数据的生物学意义

  • 对RNAseq、微阵列和real-time PCR数据进行智能分析
  • 富集各种通路、生物学过程和疾病
  • 基因与疾病关联的探索
  • 差异表达基因间的关系鉴定
  
 
 
 
 
Ingenuity iReport是一种交互式的网页报告,适用于RNAseq、微阵列和real-time PCR平台的基因表达实验。Ingenuity iReport提供了快速且准确的实验数据生物学和统计学分析。
 
性能
提供各种功能,可实现准确的智能数据解释
富集各种通路、生物学过程和疾病
Ingenuity iReport使用Ingenuity Knowledge Base中的内容和诸如Fisher精确检验等分析方法,进行注释富集分析,鉴定数据库差异表达基因中过度表达的通路、生物学过程和疾病。利用Ingenuity iReport,可以在主要生物学过程中显示上述基因。您可以利用科学文献中的证据轻松证明这些基因在生物学过程中的作用。
基因与疾病的关联
Ingenuity iReport除可以实现基因与疾病注释之间的简单关联外,还可以根据生物标记物、药物靶点、基因表达和科学文献以及值得信赖的数据库(如clinicaltrials.gov和小鼠基因组数据库)中的突变证据对其关联进行进一步分类。
分子相互作用
鉴定差异表达基因之间的分子相互作用,显示调控(表达、活化、翻译后修饰)和物理相互作用(蛋白质:DNA、蛋白质:蛋白质结合)。
人RNAseq数据的异形体水平的分析
Ingenuity iReport可以鉴定在条件和对照样本中差异表达的异形体,在Isoform View中解释上述表达差异的影响,Isoform View显示了可变剪接的转录本及其染色体位点的详细信息、预测的蛋白质结构域和编码的蛋白质异形体。

The Wheel
利用The Wheel可以从与您的研究最相关的主题开始,浏览整个iReport:特定基因、生物学过程、细胞表型或通路。利用可视化提示,根据分子功能、通路成员、亚细胞位置或分子间相互作用对基因进行分组,查找主要的基因表达变化。
特定主题的书目创建和导出
文献和发现包括了证明差异表达基因在通路、表型、疾病和分子相互作用中的功能的证据。利用iReport可以轻松编写并导出关键文献列表。以EndNote格式导出上述书目,将iReport中的信息整合至现有的参考数据库内。
无限制共享
与同事和合作者共享iReport十分简单。在共享(Share)栏中输入他们的电子邮件,他们将可以无限制访问iReport中的数据分析和生物学观点。
原理
海量数据库知识
Ingenuity iReport利用Ingenuity Knowledge Base——专业的生物学相互作用和功能注释知识库,包括海量的蛋白质、基因、复合物、细胞、组织、药物和疾病建模关系信息。这些模型化的关系包括丰富的资料,可链接至原始文章,其准确性已经过博士科学家审查。Knowledge Base中的专业内容被整合至本体中,可供您了解背景信息、应用计算以及同义词分解,确保概念的一致性。这些特性使得Ingenuity Knowledge Base成为远胜于其他数据库的独特数据库。
不同的表达流程
Ingenuity iReport的数据分析流程整合了统计学、质量和基因表达数据的差异表达分析方面的最佳措施。Ingenuity iReport数据分析采用R统计编程语言编写,大量使用了Bioconductor项目——使用广泛且引用频繁的高通量基因组数据分析工具集。
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